Peta kursi pesawat Amakusa Airlines ATR 42-600 Amakusa Airlines

Amakusa Airlines hanya menggunakan varian ATR 42-600. Hingga 48 penumpang dapat muat dalam peta kursi. Hanya kelas ekonomi yang diperuntukkan untuk pesawat ini. Rak bagasi yang lebih besar dan kursi penumpang yang lebih ringan adalah fitur dari pesawat ini. ATR 42 juga menggunakan sedikit bahan bakar, menjadikannya pesawat yang hemat biaya. Pesawat ATR 42-600 yang digunakan oleh maskapai ini memiliki area kargo khusus yang dapat menampung berbagai kargo, termasuk kargo umum, barang yang mudah rusak, dan bahan kimia berbahaya. Pelanggan menerima penawaran dari departemen kargo maskapai, yang juga mengenakan tarif yang wajar untuk mengangkut kargo. Maskapai ini juga menyediakan transportasi dari dan ke bandara.